（1）白粉病发生在谷雨至立夏期间，春末夏初时易出现，危害叶及茎部，叶片变黄退绿，生有白色粉状物，重者可致叶片枯萎。可用可湿性甲基托布津50%粉剂1000～1200倍液或80单位庆丰霉素连续喷洒2～4次。除治白粉病应早期动手，发生初期要防治1次，病发旺期连续防治2～3次。
（2）锈病多发生在清明至芒种期间(4～5月份)，危害叶片。发病后，叶背出现赤褐色突起，叶面生有黄色斑点，导致全叶卷缩枯萎脱落。发病初期喷洒300～400倍敌锈纳液或0.2～0.3度玻美石硫合剂，以后每隔7～10天，连续再喷2～3次。
（3）菌核病是危害益母草较严重的病害。整个生长期内均会发生，春播者在谷雨至立夏期间、秋播者在霜降至立冬期间病害发生严重，多因多雨、气候潮湿而致。染病后，其基部出现白色斑点，继而皮层腐烂，病部有白色丝绢状菌丝，幼苗染病时，患部腐烂死亡，若在抽茎期染病，表皮脱落，内部呈纤维状直至植株死亡。防治方法：一是在选地时就多加重视，坚持水旱地轮作，以跟禾本作物轮作为宜；二是在发现病毒侵蚀时，及时铲除病土，并撒生石灰粉，同时喷洒600倍65%代森锌可湿性粉剂或波尔多液1∶1∶300的溶液。
虫害 有蚜虫、地老虎等。
（1）蚜虫较为严重，危害植株，常致其萎缩死亡。防治方法：一是适时播种，避开害虫生长期，减轻蚜虫危害。二是发生后，用烟草石灰水1∶1∶10溶液或2000倍40%乐果乳油液喷杀。
（2）地老虎危害幼苗，易造成缺株短苗。防治方法：可采取堆草透杀、早晨捕杀的办法，同时还可用毒饵毒杀。
此外，益母草园地还会发生红蜘蛛、蛴螬等害虫，但不严重，以常规办法除治即可。再就是兽害，即在幼苗期间，常有野兔吃食，可在田间抹石灰或作草人布障惊骇或猎捕，防止幼苗被毁。
